L’Archivio storico della diocesi di Como conserva tre fondi propri (Curia vescovile di Como, Mensa vescovile di Como, Opera pia Gallio) e fondi annessi – donati o depositati – di altri enti ecclesiastici, di associazioni laicali, di privati, oltre ad alcuni “singoli” pezzi.

• Curia vescovile di Como <Como>
• Mensa vescovile di Como
• Opera pia Gallio <Como>
  
   

Archivi ecclesiastici
 

• Capitolo della cattedrale di Como con Collegio dei mansionari e Biblioteca
• Fabbrica del duomo di Como
• Parrocchia di Sant'Anna in Como presso l'Ospedale Sant'Anna <Como> (inventario analitico completo)
  
  Complesso fondi della parrocchia di San Giorgio in Como
• Parrocchia di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Fabbriceria della chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Confraternita del Santissimo Sacramento nella chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Confraternita di Santa Teresa nella chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Congregazione del Terz'ordine di San Francesco d'Assisi nella chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Confraternita di San Luigi Gonzaga nella chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Confraternita di Nostra Signora del Sacro Cuore di Gesù nella chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Comitato parrocchiale e Consiglio parrocchiale di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Circolo popolare cattolico di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Oratorio di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)
• Unione donne cattoliche nella chiesa di San Giorgio in Como <Como> (inventario analitico completo)

Archivi di associazioni, di famiglie, di ditte, di persone
 

• Circolo educativo "Alessandro Volta" <Como>
• Ditta Giorgio Pruneri - Fonderia di campane <Grosio>
• Famiglia Durini
• Famiglia Odescalchi. Beni in Vedano (inventario analitico completo)
• Famiglia Erba Odescalchi. Epistolario di Benedetto Odescalchi - papa Innocenzo XI 
• Carte Maurizio Monti
• Famiglia Odescalchi-Giovio di Monte Caprino. Donazione Giovanni Magni
• Laudario dei Battuti
• Stemmario Bosisio
• Alessandro Maggiolini (inventario analitico completo)

Bibliografia sull'Archivio storico della diocesi di Como:
- Diocesi di Como, a cura di A. Caprioli, A. Rimoldi, L. Vaccaro, Brescia, La Scuola, 1986, p. 305 (Storia religiosa della Lombardia, 4).
- P. Gini, L'Archivio vescovile di Como e i suoi fondi documentali, in «Arte lombarda», XVI (1971), pp. 55-60.
- Guida degli Archivi diocesani d'Italia, a cura di V. Monachino, E. Boaga, L. Osbat, S. Palese, vol. II, in «Archiva Ecclesiae», 36-37 (1993-1994), pp. 80-83.
- La diocesi di Como. Dati e notizie per il 1995, in «Bollettino ecclesiastico ufficiale della diocesi di Como», 1994, suppl. n. 11, p. 20.
- Regole per la curia vescovile di Como, in «Bollettino ecclesiastico ufficiale della diocesi di Como», X (1936), pp. 112-118, p. 114.
- Terre del Ticino. Diocesi di Lugano, a cura di L. Vaccaro, G. Chiesi, F. Panzera, Brescia, La Scuola, 2003, pp. 433-436.
- S. Xeres, «Nuove» fonti per la storia ecclesiastica ticinese dall'Archivio storico della diocesi di Como, in Carte che vivono. Studi in onore di don Giuseppe Gallizia, a cura di D. Jauch, F. Panzera, Locarno, Armando Dadò, 1997, pp. 441-446.